La Fundación para la Aplicación y Enseñanza de las Ciencias (FUNDAEC) adquirió su Personería Jurídica como institución sin ánimo de lucro el 25 de octubre de 1974, por Resolución 004747 de la Gobernación del Departamento del Valle, República de Colombia.

Los orígenes de FUNDAEC se remontan a los primeros años de la década de los 70, cuando un grupo de profesionales de variadas disciplinas, preocupados por los efectos negativos de los procesos de desarrollo puestos en marcha después de la

II Guerra Mundial, en sus frecuentes deliberaciones esbozaron lo que sería un modelo de desarrollo integral para las poblaciones rurales, sustentado en una participación verdadera de sus habitantes. El grupo era liderado por Farzam Arbab, un físico renombrado que había llegado como profesor visitante a la Universidad del Valle en 1970.

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DESDE SUS INICIOS, FUNDAEC ha dedicado sus esfuerzos a crear capacidad en una región para permitirle a la población llevar a cabo acción e investigación relacionadas con los diversos procesos que componen su vida social, económica y cultural. Para cada uno de estos procesos, FUNDAEC, junto con miembros de las comunidades locales, ha tratado de establecer un proceso paralelo de aprendizaje con el fin de transformar las prácticas diarias y así mejorar el bienestar de toda la población. Uno de los procesos que ha recibido la mayor atención a lo largo de los años, y en torno al cual se ha generado una cantidad considerable de conocimiento, es el relacionado con la educación. 

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Se ha aprendido mucho a través de proyectos que cuidadosamente han sido ejecutados en los ámbitos de la educación, así como en esferas tales como la agricultura, la organización comunitaria y la economía local. El conocimiento generado a partir de estos proyectos se ha condensado para formular una serie de programas de educación para el desarrollo, en los que se incluyen el de Preparación para la Acción Social, Apoyo a Líderes Comunitarios, Sistema de Aprendizaje Tutorial, grupos de acción ambiental e innovadores programas de alfabetización.